Tramp je smenio Komija 9. maja. U Beloj kući su naglasili da se to desilo zbog predsednikovog „gubitka poverenja“. U propratnom pismu rukovodiocu resora, šef države je saopštio da je doneo ovakvu odluku nakon preporuke generalnog tužioca, ministra pravde Džefa Sešonsa.
Prema Komijevoj verziji, mešutim, razlog za neraspoloženje novog predsednika prema njemu bio je zajednički ručak koji je održan u Beloj kući u januaru, samo nekoliko nedelja nakon Trampove inauguracije. Kako piše list, za vreme ručka Tramp je nekoliko puta zamolio šefa FBI da potvrdi svoju lojalnost, ali je kao odgovor Komi izjavio da predsednik može računati samo na njegovo „poštenje“.
U Beloj kući su izjavili da ova informacija nije istinita. Sam Tramp je u intervjuu televiziji En-Bi-Si ispričao o zajedničkom ručku sa Komijem, ali nije pomenuo razgovor o lojalnosti. U oproštajnom pismu nakon ostavke, Komi je naveo da šef države može da otpusti šefa FBI „iz bilo kojeg razloga, ili bez ikakvog razloga“ i naglasio da ne namerava da „troši vreme za razgovor o toj odluci i onome što je realizovano“.
