General Tolimir bio je pomoćnik za obaveštajno bezbednosne poslove nekadašnjeg komandanta Vojske Republike Srpske Ratka Mladića, kojem se takođe sudi u Haškom tribunalu.
Sudsko veće je 2012. godine većinom glasova ustanovilo je da je Tolimir bio član tzv. zajedničkog zločinačkog poduhvata, čiji je cilj bio ubistvo muslimanskih zarobljenika iz Srebrenice i proterivanje civila sa tog prostora.
Tolimir je bio prisutan i u Srebrenici i Žepi u julu 1995. godine, kada je izvršen taj zločin, i ne samo da je znao šta se dešavalo u tom gradu, nego je delio genocidnu nameru i lično predlagao ubijanje izbeglica, a potom pomagao u prikrivanju zločina, utvrdile su sudije.
Tolimir je uhapšen krajem maja 2007. godine.
Zdravko Tolimir nije jedini oficir VRS koji je zbog zločina u Srebrenici osuđen na najtežu kaznu. Doživotni zatvor prvostepenom presudom određen je i Ljubiši Beari, načelniku za bezbednost Glavnog štaba VRS i Vujadinu Popoviću, bivšem potpukovniku Drinskog korpusa. Drago Nikolić, potporučnik Zvorničke brigade osuđen je na 35 godina zatvora, a na istu kaznu pravosnažnom presudom osuđen je i nekadašnji komandant Drinskog korpusa Radisav Krstić.
Na višegodišnje kazne zatvora osuđeno je još desetak oficira VRS-a uključujući i one koji su priznali krivicu.
