Tokom bošnjačko-hrvatskog sukoba u Mostaru, most je predstavljao jedinu vezu između istočne obale Neretve, pod nazdorom Armije BiH i manjeg dela grada na desnoj obali, koji je takođe bio pod bošnjačkom kontrolom.
Snimak rušenja mosta je obišao je svet, a mediji su optužili jedinice hrvatskih snaga HVO, što Međunarodni krivični sud za bivšu Jugoslaviju nije dokazao.
Kako prenose mediji u BiH, sumnja se da ga je srušila Armija BiH, a da je odgovornost prebačena na Hrvate.
Do danas, međutim, niko iz HVO nije preuzeo odgovornost za rušenje mosta.
Obnova mosta nakon rata je trajala sedam godina i koštala je 13,5 miliona dolara od sredstava Svetske banke, donacija Turske, Italije, Holandije i Hrvatske.
Stari most i stara gradska jezgra Mostara 2005. godine službeno se nalaze na spisku zaštićene kulturne baštine Uneska.
Ovaj most bio je najveća lučna konstrukcija na svetu širine četiri metra i 30 metara dužine.
Most, koji je postao simbol Mostara, sagrađen je 1566. godine u vreme Sulejmana Veličanstvenog, a graditelj je bio Mimar Hajrudin.
