Migingo se nalazi na teritoriji Kenije, a ta zemlja je zbog njega bila u sukobu sa Ugandom koja je tvrdila da ribari pecaju u njenim vodama, samo 500 metara od ostrva.
Poznat i kao „najmanji afrički rat“, sukob između dve zemlje doživeo je vrhunac 2008. godine, kada je Uganda na Migingo poslala vojsku sa ciljem da evakuiše kenijske ribare i preuzme kontrolu nad ostrvom.
Tenzije su bile visoke i godinama nakon toga, ali je 2016. godine konačno sklopljen dogovor. Obe zemlje oporezivaće ribare koji pecaju u tim vodama i udruženim snagama će se boriti protiv gusara.
Prema poslednjem popisu iz 2009. na ostrvu je živeo 131 stanovnik, ali prema informacijama iz dokumentarnog filma RT, čiji su novinari posetili Migingo, tamo je 2015. godine živelo čak 1.000 ljudi.