Federalni istražni biro, Centralna obaveštajna agencija, Agencija za nacionalnu bezbjednost i Uprava za trezor istraživali su Flinove kontakte, ali nije jasno kada je istraga počela, da li je završena i kakvi su rezultati, piše list „Volstrit džurnal“ pozivajući se na neimenovane izvore.
List navodi da je cilj istrage bio da se otkrije priroda Flinovih kontakata sa ruskim zvaničnicima i to da li su oni bili protivzakoniti.
Istraga je, navodno, bila usmerena na Flinov telefonski poziv ruskom ambasadoru u Sjedinjenim Američkim Državama Sergeju Kisljaku 29. decembra 2016, kada je ambasador pozvao Flina da učestvuje u mirovnim pregovorima o Siriji u Astani.
Bela kuća je, navodno, negirala bilo kakvo saznanje o istrazi i da li je bilo osnova za istragu.
Flin nije jedini član Trampove administracije čije su se veze sa Rusijom suočile sa intenzivnom proverom. Trampov državni sekretar, Reks Tilerson, morao je da podnese detaljan izveštaj o svojoj potencijalnoj politici prema Rusiji u svojoj raspravi pred Kongresom dok su mediji dovodili u pitanje njegove veze sa Moskvom.