Nakon otkaza u Fenerbahčeu, Murinjo je kratko vreme bio bez kluba, da bi usledio kontakt i pregovori sa slavnim klubom iz Lisabona.
Po svemu sudeći, Žoze će posle 25 godina ponovo biti trener Benfike, kluba u kom je sve počelo. Posle Barselone u kojoj je u periodu od 1996. do 2000. bio pomoćnih ser Bobija Robsona, obreo se 2000. na klupi Benfike.
Lisabonski Orlovi nisu časili časa posle šokantnog poraza od Karabaga na premijeri Lige šampiona. Vodila je Benfika ranim golovima sa 2:0, da bi do kraja meča pretrpela istinski šok i poraz rezultatom 3:2.
Uprava kluba ekspresno je smenila Bruna Laža, i pozvala Žozea Murinja, kom jeste prvi tim bila Benfika, ali je najveće uspehe beležio upravo sa Portom. Osvojio je sa klubom sa Dragaa Ligu šampiona, posle čega je preuzeo londonski Čelsi.
Murinjo i Benfika potpisaće dvogodišnji ugovor, koji će biti na snazi do juna 2027. godine.